%0 Journal Article
%T Genetic diversity and quantification of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria in Hugangyan Maar Lake based on pufM DNA and mRNA analysis<br>玛珥湖好氧不产氧光合细菌pufM基因DNA和mRNA的定量及多样性分析
%A CHEN Xiao-Jie
%A ZENG Yong-Hui
%A JIAN Ji-Chang
%A LU Yi-Shan
%A WU Zao-He
%A <br>陈晓洁
%A 曾永辉
%A 简纪常
%A 鲁义善
%A 吴灶和
%J 微生物学通报
%D 2012
%I 
%X 【目的】湖光岩玛珥湖是一类特殊的火山口湖, 它完全封闭, 地质年代久远, 尚未受人类活动的剧烈影响, 蕴育着丰富而特殊的微生物种群。好氧不产氧光合细菌(AAPB)是以其在有氧情况下能行使光合功能而定义的一类专性异养细菌, 其生理生态特征独特, 进化年代久远, 在水生生态系统的上层水体中广泛分布。目前, AAPB在玛珥湖水体中是否有分布仍是未知。【方法】构建和比较夏季湖水1 m、5 m、12 m三个水层的总DNA和总RNA的AAPB光合中心合成的关键基因pufM的6个克隆文库, 并结合定量PCR技术, 分析了不同水层AAPB的分布、系统发育多样性及其在总细菌中的比重。【结果】6个文库覆盖率和稀释曲线显示样本初步揭示了各水层优势AAPB类群的多样性。BLAST核苷酸同源性介于80%?93%; 多样性指数表明, 湖光岩表层和底层多样性相当, 中间层最低, 总RNA的多样性高于总DNA。系统发育分析结果表明, OTU21?24所含的序列(占总序列的49.43%)与β-变形细菌的进化距离最接近, 是湖光岩玛珥湖的优势AAPB菌群。定量PCR结果显示1 m水层中AAPB在总细菌中的比重最高, 可达38.06%; 而5 m水层中AAPB所占的比重最低, 仅为0.85%; 12 m为9.54%。【结论】湖光岩玛珥湖孕育着丰富而多样的AAPB类群。
%K Huguangyan Maar Lake
%K Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria
%K pufM diversity
%K Q-PCR
%K Phylogenetic analysis<br>湖光岩
%K 玛珥湖
%K 好氧不产氧光合细菌
%K pufM
%K 多样性
%K 荧光定量PCR
%K 系统发育分析
%U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=78024727B5F4EF6AA9CA8E605B5FC464&aid=324F8504B2709856914BC8CE0C95A8C1&yid=99E9153A83D4CB11&vid=7C3A4C1EE6A45749&iid=708DD6B15D2464E8&sid=0E6C9B38667ABC5C&eid=FAE014814EB8ABBA&journal_id=0253-2654&journal_name=微生物学通报&referenced_num=0&reference_num=0