%0 Journal Article %T Archaeal community structure and diversity in Urumqi No.10 cold sulfur Spring analyzed by culture-independent approach
新疆乌鲁木齐10号冷泉古菌群落结构多样性 %A Ping Li %A Jun Zeng %A Yunus Zulipiy %A Xiaoqi Gao %A Xiuhuang Dong %A Juan Xue %A Kai Lou %A
李萍 %A 曾军 %A 祖丽皮亚·玉努斯 %A 高小其 %A 董秀黄 %A 薛娟 %A 娄恺 %J 微生物学报 %D 2013 %I %X 摘要:【目的】探究新疆地震断裂带含硫冷泉泉水古菌群落组成及多样性。【方法】利用酶解法直接从冷泉泉水样品中提取环境总DNA,采用古菌通用引物对16S rRNA基因进行扩增,构建16S rRNA基因克隆文库,通过Alu I和Afa I两种限制性内切酶对随机挑选的115个阳性克隆子进行酶切分型,将不同酶切带型对应的克隆子送样测序,测序结果与GenBank序列进行比对并构建16S rRNA基因系统发育树。【结果】古菌克隆文库中共得到44个不同的酶切带型,BLAST序列比对和系统发育分析将它们划分于广古菌门(Euryarchaeota,94.78%)和奇古菌门(Thaumarchaeota,4.35%)。奇古菌门克隆与Nitrosopumilus. sp序列相似性达到了93%;而广古菌门类群较为多样,其中,42.61%的克隆子属于RC-V cluster,20.87%与13.91%的克隆子分别属于LDS cluster和Methanomicrobiales,4.35%的克隆子与甲烷厌氧氧化相关的类群(ANME-1a-FW)具有较高的的相似。另外,13.05%的克隆子属于广古菌门中的未知类群。【结论】乌鲁木齐10号泉水体中广古菌类群多样,可能蕴藏有大量潜在的古菌新类群。 %K 关键词:含硫冷泉,古菌,16S %K rRNA基因克隆文库,断裂带 %U http://www.alljournals.cn/get_abstract_url.aspx?pcid=90BA3D13E7F3BC869AC96FB3DA594E3FE34FBF7B8BC0E591&jid=A3C6BA55AB623B90FA9104CFFC826F3C&aid=62DBC20A59286BA3B4E55BF444B2CD77&yid=FF7AA908D58E97FA&vid=8E6AB9C3EBAAE921&iid=38B194292C032A66&sid=D6354F61445E9456&eid=C812B90E96151014&journal_id=0001-6209&journal_name=微生物学报&referenced_num=0&reference_num=0