%0 Journal Article
%T 大豆HB基因GmSbh1的分离与生物信息学分析
%A 舒英杰
%A 陶源
%A 王爽
%A 黄丽燕
%A 陈明
%A 麻浩
%J 大豆科学
%D 2015
%R 10.11861/j.issn.1000-9841.2015.02.0212
%X 从大豆叶片中分离到GmSbh1基因cDNA的完整开放阅读框（ORF）序列，对其编码的氨基酸序列、蛋白质一级、二级结构及互作蛋白等进行了生物信息学分析。结果表明：在GmSbh1基因cDNA序列的第156~1293bp处有一个完整的ORF，编码379个氨基酸；GmSbh1具有同源异型盒（homeoboxbox，HB）基因家族典型的KNOX1、KNOX2、ELK和Homeodomain(HD)结构域；检索到18条与GmSbh1核酸序列一致性大于80%的序列；GmSBH1为亲水性蛋白，不具有信号肽，分子量为42.37kDa，其中丝氨酸（Ser）、天冬氨酸（Asn）和亮氨酸（Leu）分别为占10%、9.8%和8.4%，可能发生磷酸化的位点分别在Ser（13个）、酪氨酸（Tyr）（2个）和苏氨酸（Thr）（1个）上；二级结构预测结果显示，GmSBH1序列存在α-螺旋（占39.31%）、β-转角（占5.28%）、延伸链（占8.44%）和无规则卷曲（占46.97%），不存在跨膜螺旋；蛋白互作预测表明，GmSBH1与拟南芥中的RPL、BEL1、AT4G32980.1-P、BLH2和BLH3等蛋白的互作程度较高，其中与BEL1共表达的几率较高。
%K 大豆
%K 同源异型盒基因
%K 基因分离
%K 生物信息学分析
%U http://ddkx.haasep.cn/oa/DArticle.aspx?type=view&id=201502006