%0 Journal Article %T 2012 - 2015年江西省啮齿动物间流行的汉坦病毒基因型和基因亚型分析<br>Genetic types and sub-types analysis of orthohantavirus in rodents in Jiangxi Province from 2012 to 2015 %A 刘师文 %A 徐刚 %A 龚甜 %A 施勇 %A 李健雄 %A 刘晓庆 %A 肖芳 %A 张艳妮 %A 周?B %A 熊英 %J 现代预防医学 %D 2018 %X 目的 了解2012 - 2015年江西省啮齿动物间流行的汉坦病毒基因型别和基因亚型。方法 选取江西省肾综合征出血热疫情发生地区捕鼠,收集鼠肺标本,采用直接免疫荧光法检测鼠肺中汉坦病毒抗原,提取阳性鼠肺标本核酸,设计并采用特异性引物分别对病毒的S、M、L 3个基因进行RT - PCR扩增,对扩增产物测序和分析。结果 共捕鼠2 235只,其中汉坦病毒阳性的86只,阳性率3.85%,流行的HV基因型为汉滩型(Hantaan orthohantavirus,HTNV)和汉城型(Seoul orthohantavirus,SEOV)。江西省HTNV之间S、M、L 3个基因核苷酸的同源性为93.4%~100%,与国内外HTNV参考株3个基因核苷酸的同源性为77.3%~88.0%,在3个基因系统进化树上均呈独立分支;M基因系统进化分析发现江西省SEOV分布在S3、S4亚型分支以及1个独立的进化分支,该独立分支的9株SEOV与国内外SEOV M基因核苷酸同源性仅为84.3%~88.7%。结论 江西省啮齿动物流行的HV为HTNV和SEOV 2种基因型别,其中HTNV为新的基因亚型,SEOV存在3个基因亚型:S3、S4和1个新的基因亚型。<br> %K 汉坦病毒 %K 基因分型 %K 基因亚型< %K br> %U http://xdyfyxzz.paperopen.com/oa/DArticle.aspx?type=view&id=20180634