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生物物理学报 2011
DNA拓扑异构酶Ⅱ的多态转换模型Keywords: DNA拓扑异构酶Ⅱ,主方程,稳态,无机磷 Abstract: DNA拓扑异构酶Ⅱ是一种分子马达,它利用ATP水解产生的化学能,切断一条双链DNA片段(G segment),并让另一条双链DNA片段(T segment)从缺口处通过。对DNA拓扑异构酶Ⅱ的工作循环研究将有助于阐明其工作机理。本文根据已有实验资料,利用主方程方法构建了DNA拓扑异构酶Ⅱ状态转变的随机跃迁模型,求得系统各态的稳态解。进而推导出稳态下无机磷(Pi)浓度随时间的变化,得到DNA拓扑异构酶Ⅱ的最小工作周期约为0.78秒,该结果同实验获得的DNA拓扑异构酶Ⅱ工作周期为0.5~1秒一致。该模型定量地分析了DNA拓扑异构酶Ⅱ的动力学行为。
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