Archaeal community structure and diversity in Urumqi No.10 cold sulfur Spring analyzed by culture-independent approach
新疆乌鲁木齐10号冷泉古菌群落结构多样性

摘要:【目的】探究新疆地震断裂带含硫冷泉泉水古菌群落组成及多样性。【方法】利用酶解法直接从冷泉泉水样品中提取环境总DNA，采用古菌通用引物对16S rRNA基因进行扩增，构建16S rRNA基因克隆文库，通过Alu I和Afa I两种限制性内切酶对随机挑选的115个阳性克隆子进行酶切分型，将不同酶切带型对应的克隆子送样测序，测序结果与GenBank序列进行比对并构建16S rRNA基因系统发育树。【结果】古菌克隆文库中共得到44个不同的酶切带型，BLAST序列比对和系统发育分析将它们划分于广古菌门(Euryarchaeota，94.78%)和奇古菌门(Thaumarchaeota，4.35%)。奇古菌门克隆与Nitrosopumilus. sp序列相似性达到了93%;而广古菌门类群较为多样，其中，42.61%的克隆子属于RC-V cluster，20.87%与13.91%的克隆子分别属于LDS cluster和Methanomicrobiales，4.35%的克隆子与甲烷厌氧氧化相关的类群(ANME-1a-FW)具有较高的的相似。另外，13.05%的克隆子属于广古菌门中的未知类群。【结论】乌鲁木齐10号泉水体中广古菌类群多样，可能蕴藏有大量潜在的古菌新类群。