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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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植物学报  2011 

Analysis of Editing Sites for Chloroplast ndhF in Ginkgo biloba and the Editing Efficiency at C290 in Response to Different Stresses
银杏叶绿体ndhF RNA编辑现象分析及C290位编辑对胁迫处理的响应

Keywords: editing efficiency,Ginkgo biloba,ndhF gene,RNA editing,stress treatment
编辑效率
,银杏,ndhF基因,RNA编辑,胁迫处理

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Abstract:

RNA编辑是一种转录后修饰加工过程, 通过碱基的插入、缺失或替换可改变氨基酸的种类, 增加蛋白质的疏水性和同源蛋白在不同物种间的保守性。该文通过DNA与cDNA序列的比对, 分析了裸子植物银杏(Ginkgo biloba)叶绿体功能基因ndhF的编辑现象, 该基因共含有21个编辑位点, 且这21个位点均为部分编辑。生物信息学分析及与其它物种比对结果表明, ndhF C290位编辑可能会影响该蛋白的正确折叠。进一步使用单克隆酶切方法测定了不同胁迫处理对ndhF C290位编辑效率的影响, 结果表明该位点的编辑效率对温度和黑暗敏感。

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