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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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海洋科学  2013 

Complete mitochondria sequence of Lutjanus argentimaculatus and Bayesian analysis
紫红笛鲷线粒体全序列与笛鲷属鱼类分化年代的贝叶斯分析

Keywords: Lutjanus argentimaculatus,mitochondrion genome,bayesian analysis,uncorrected relaxed lognormal clock,snapper fish
紫红笛鲷(Lutjanus
,),线粒体全序列,贝叶斯分析,松散分子钟,笛鲷属鱼类

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Abstract:

利用常规PCR 未纯化产物直接测序的方法, 获得紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)全长为16 543 bp 线粒体DNA 全序列, GenBank 登录号为JN182927。结合GenBank 中的已有数据比较分析表明: 紫红笛鲷与笛鲷属(Lutjanus)线粒体基因组成基本一致, 符合脊椎动物的特征, 各基因间进化速率差异显著; 13 个蛋白编码基因拼接序列贝叶斯建树的后验率显著高于单基因或全序列, 更适用于笛鲷属的贝叶斯法系统分化分析和年代推断; 13 个蛋白编码基因及其拼接序列进行的系统进化分析均支持紫红笛鲷与勒氏笛鲷(Lutjanus russellii)及海鸡母笛鲷(Lutjanus rivulatus)亲缘关系较近; 基于13 个蛋白编码基因拼接序列的贝叶斯松散分子钟推算出笛鲷属鱼类两个主要支系大约在61.5Ma 前古新世的达宁阶与蒙蒂阶交界时期发生分化。

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