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OALib Journal期刊
ISSN: 2333-9721
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SAMTa - Uma nova proposta para análise computacional de dinamicas moleculares = SAMTa - A new proposal for computational analysis of molecular dynamics

Keywords: SAMTa , molecular dynamics analysis , computational chemistry , mathematical analysis , KMeans algorithm

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Abstract:

Este artigo trata de uma síntese sobre a aplica o SAMTa (Sistema de Análise Molecular de Trajetórias). Aborda sobre a simula o de compostos moleculares, utilizando recursos computacionais, o método de sele o por análise matemática e sua proposta de solu o pelo algoritmo de clustering K-Means. Apresenta resultados acerca dodesenvolvimento e utiliza o do software, ilustrando com um estudo de caso de desenvolvimento de inibidores da EPSP sintase. This article provides an overview of the implementation of the System for Molecular Analysis of Trajectories (SAMTa, acronym in Portuguese). It addresses the simulation of molecular compounds using computer approaches, the method of selection by mathematical analysis using K-Means. The results on the development and use of thesoftware are illustrated with a case study concerning EPSP synthase inhibitors.

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