Optimalisasi ekstraksi DNA jarak pagar (Jatropha curcas) melalui pemilihan daun yang sesuai

Prayitno E, Nuryandani E. 2011. Optimalisasi ekstraksi DNA jarak pagar (Jatropha curcas) melalui pemilihan daun yang sesuai. Bioteknologi 8: 24-31. Jarak pagar (Jatropha curcas L.) mempunyai peran penting sebagai sumber bahan bakar nabati. Usaha pemuliaan tanaman ini secara molekuler sering terkendala sulitnya ekstraksi DNA. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui daun yang sesuai untuk digunakan sebagai sumber DNA. Penelitian ini dilakukan pada empat aksesi jarak pagar yaitu J1 dan J2 (Jawa Tengah), S1 (Sumatera Selatan), dan S2 (Bengkulu). Ekstraksi dilakukan pada daun pertama, ketiga, kelima, ketujuh, dan daun kuning dari setiap aksesi dengan metode Doyle and Doyle (1987) yang dimodifikasi. Kualitas dan kuantitas DNA hasil ekstraksi diketahui melalui visualisasi dengan pembanding DNA lambda, spektrofotometer UV-Vis pada panjang gelombang 260/280, dan pemotongan menggunakan enzim EcoRI. Hasil penelitiaan menunjukkan bahwa daun ketiga memadai untuk digunakan sebagai sumber DNA. Kuantitas DNA daun ketiga J1 (19,33 μg/mL), J2 (26,21 μg/mL), S1 (31,20 μg/mL), dan S2 (61,03 μg/mL). Sedangkan kemurniannya masing-masing yaitu 1,9063 (J11), 2,0162 (J2), 2,0116 (S1), dan 2,0856 (S2).