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园艺学报 2015
水茄泛素结合酶e2基因stubcc的克隆及黄萎病菌诱导表达分析DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0151, PP. 1185-1194 Abstract: 以茄子近缘野生种水茄(solanumtorvumswartz)幼苗根部为试材,并以黄萎病菌(大丽轮枝菌,verticilliumdahliaekleb)处理的水茄的抑制差减文库中差异表达的est片段f290为基础,利用race技术,获得一个756bp的cdna全长序列。经生物信息学分析发现该序列为泛素结合酶e2-2(ubc2)载体蛋白同源基因,命名为stubcc,genbank登录号为kp330492。stubcc基因编码区共459bp,编码152个氨基酸,该蛋白分子量为63.0925kd,等电点为5.13。采用mega5软件对stubcc和其他同源蛋白的氨基酸序列比对,结果表明其与葡萄的同源蛋白一致性最高,达99%,有很高的功能区段保守性。采用荧光定量pcr对黄萎病菌侵染不同时间的水茄幼苗根部stubcc基因的表达量进行测定,发现在侵染6h后,表达量最高,为对照(无菌水处理)的6.79倍。
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