一种高效的苹果褪绿叶斑病毒TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR检测方法

为建立一种检测苹果褪绿叶斑病毒(Applechloroticleafspotvirus,ACLSV)的TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR方法,根据ACLSV外壳蛋白基因(coatprotein,cp)保守序列设计了特异性引物和TaqMan探针,以构建的ACLSV-cp重组质粒为阳性标准品绘制标准曲线,并对该方法的特异性、灵敏性、重复性进行检验。结果显示,以ACLSV-cp重组质粒为标准品建立的标准曲线相关系数达0.999,扩增效率为103.7%;建立的TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR方法特异性好,与苹果茎沟病毒(Applestemgroovingvirus,ASGV)、苹果茎痘病毒(Applestempittingvirus,ASPV)、苹果锈果类病毒(Applescarskinviroid,ASSVd)均无交叉反应;灵敏度为100拷贝/μL,比常规RT-PCR高100倍;批内和批间变异系数均小于0.84%。表明TaqMan探针实时荧光定量RT-PCR方法具有特异性强、灵敏性高、重复性好的优点,适用于实际样品中ACLSV的快速准确检测。