雏菊rbcL基因的克隆及其生物信息学分析

以雏菊为试验材料，采用PCR方法扩增雏菊rbcL基因并测序，并用DNAstar、PAML等生物软件对该基因进行生物信息学及其适应性进化研究。结果表明雏菊rbcL基因序列全长1508bp，编码区全长1458bp，共编码485个氨基酸，与基因库中菊科其它属植物比较，核苷酸和氨基酸序列的同源性均超过了96%。rbcL蛋白二级结构主要有20个α螺旋、17个β折叠、33个转角以及一些无规则卷曲，适应性进化检测发现共有3个正选择氨基酸位点(94E,149Q,309M)。获得完整雏菊rbcL基因有助于更深地研究雏菊对其生境的适应，rbcL蛋白大亚基正选择位点的空间结构对于维持核酮糖结构具有重要的作用。？