珠三角地区鸭坦布苏病毒的全基因序列测定与分析

【目的】了解2010年以来分离于珠三角地区鸭坦布苏病毒病（DuckTembusuvirus，DTMUV）GDNS2010.1、GDNS2010.2、GDZQ2012、GDPY2013株的分子特征.【方法】参考GenBank收藏的DTMUVJS804株，共设计合成11对特异性引物，扩增了4株病毒的全基因序列片段.【结果和结论】4株病毒全长约为10990bp，无Ploy(A)尾结构，仅含有1个大的ORF，共编码3426个氨基酸，5′非编码区(5′UTR)各含有94bp.在3′非编码区(3′UTR)，GDNS2010.1、GDNS2010.2毒株在103395～103411bp处缺失10个碱基.联合前期试验已测定的2株病毒序列（GDHZ2012.1、GDHZ2012.2）,用DNAstar和MEGA6.0序列分析软件将6株病毒同GenBank收藏的国内的其他坦布苏病毒株比对，发现核酸序列相似性在98%以上，与Ntaya病毒和Sitiawan病毒相似性较大，相似性都在73%左右；与西尼罗河病毒、日本乙型脑炎病毒、黄热病毒等相似性皆低于63%.6株病毒囊膜蛋白E核酸序列相似性为97.5%～99.9%，推导氨基酸序列相似性在97%以上，其中同一地区分离的毒株相似性最高，达99.9%；在囊膜蛋白E154位存在一潜在的糖基化位点Asn-Try-Ser,在E蛋白结构域Ⅱ第E289位，极性带正电荷的Lys变为极性带负电荷的Glu，推测这一位点可能为病毒的毒力位点.