药用植物华重楼(黑药花科)叶绿体全基因组研究

为探究华重楼(parispolyphyllavar.chinensis)的叶绿体基因组特征,利用叶绿体系统发育基因组学方法,对华重楼与其它百合目植物的叶绿体全基因组进行了比较。结果表明,华重楼的叶绿体全基因组长158307bp,由4个区组成,包括2个反向重复区(ira和irb,27473bp)、1个小单拷贝区(ssc,18175bp)和1个大单拷贝区(lsc,85187bp)。其叶绿体基因组有115个基因,包括81个编码蛋白质基因、30个转运rna基因和4个核糖体rna基因。11种百合目植物的叶绿体全基因组的基因组成和基因顺序相似。华重楼的cema基因是假基因,其起始密码子后有多聚核苷酸poly(a)及ca双核苷酸重复序列,编码序列中出现多个终止密码子,且与北重楼(parisverticillata)的cema编码序列中的终止密码子位置不同。因此,华重楼叶绿体基因组比较保守;cema结构及假基因化现象可能具有重要的进化与系统发育信息,其编码序列中的终止密码子可以区分华重楼和北重楼。