2012 - 2015年江西省啮齿动物间流行的汉坦病毒基因型和基因亚型分析
Genetic types and sub-types analysis of orthohantavirus in rodents in Jiangxi Province from 2012 to 2015

目的 了解2012 - 2015年江西省啮齿动物间流行的汉坦病毒基因型别和基因亚型。方法 选取江西省肾综合征出血热疫情发生地区捕鼠，收集鼠肺标本，采用直接免疫荧光法检测鼠肺中汉坦病毒抗原，提取阳性鼠肺标本核酸，设计并采用特异性引物分别对病毒的S、M、L 3个基因进行RT - PCR扩增，对扩增产物测序和分析。结果 共捕鼠2 235只，其中汉坦病毒阳性的86只，阳性率3.85%，流行的HV基因型为汉滩型(Hantaan orthohantavirus，HTNV)和汉城型（Seoul orthohantavirus，SEOV）。江西省HTNV之间S、M、L 3个基因核苷酸的同源性为93.4%～100%，与国内外HTNV参考株3个基因核苷酸的同源性为77.3%～88.0%，在3个基因系统进化树上均呈独立分支；M基因系统进化分析发现江西省SEOV分布在S3、S4亚型分支以及1个独立的进化分支，该独立分支的9株SEOV与国内外SEOV M基因核苷酸同源性仅为84.3%～88.7%。结论 江西省啮齿动物流行的HV为HTNV和SEOV 2种基因型别，其中HTNV为新的基因亚型，SEOV存在3个基因亚型：S3、S4和1个新的基因亚型。