mRNA环结构对蛋白质折叠速率的影响

前期的相关研究发现mRNA二级结构中存在对蛋白质折叠速率的重要影响因素．而mRNA二级结构中普遍存在着各种复杂的环结构，这些环结构是否对蛋白质折叠速率也有重要的影响呢？不同的环结构对蛋白质折叠速率的影响是否相同呢？基于此想法，建立了一个包含mRNA内部环、发夹环、膨胀环和多分支环等环结构信息和相应蛋白质折叠速率的数据库．对于数据库中的每一个蛋白质，计算了mRNA二级结构中各种环结构碱基含量、配对碱基含量及单链碱基含量等参量，分析了各参量与相应蛋白质折叠速率的相关性．结果显示，各种环结构碱基含量与蛋白质折叠速率均呈极显著或显著正相关．说明mRNA环结构对蛋白质折叠速率有重要的影响．进一步，把蛋白质按照不同折叠类型或不同二级结构类型分组后，对每一组蛋白质重复上述的分析工作．结果表明，对不同类蛋白质，mRNA的各种环结构对其相应蛋白质折叠速率的影响存在着显著差异．上述研究将为进一步开展有关mRNA和蛋白质折叠速率的研究奠定理论基础