抗菌肽BLFcin6与不同磷脂膜之间相互作用的分子动力学模拟研究

抗菌肽具有广谱抗菌特性，有望成为抗生素较好的替代产品．研究抗菌肽的抗菌机制，可以为新型抗菌肽的设计提供指导．无论抗菌肽采用哪种抗菌机制，其首先要稳定地吸附到细胞膜之上．因此，本文利用分子动力学模拟方法比较了抗菌小肽BLFcin6与5种不同细胞膜之间的相互作用．对这5种细胞膜而言，小肽会很快结合在POPG膜和DPPC-CHOL膜的表面，倾向于进入DPPC膜的疏水内部，与POPC膜和POPC-CHOL膜的接触很少．考察相互作用能，小肽与POPG膜的相互作用最强，主要是小肽与细胞膜亲水头部存在静电相互作用；小肽与DPPC膜的疏水尾部的相互作用较强，但受胆固醇影响，小肽只结合在DPPC-CHOL膜表面．在结合过程中，小肽N端的Arg会先结合到细胞膜上，静电相互作用在小肽锚定细胞膜的过程中起关键作用．以上研究从原子水平上解释了为什么BLFcin6小肽具有抗菌作用，哪些残基起关键作用，也为进一步开展BLFcin6小肽及其衍生小肽的研究奠定基础