水滴伪康纤虫全长cDNA文库的构建及EST分析

摘要： 水滴伪康纤虫为海水养殖鱼类的重要危害性寄生虫。采用SMART技术构建营养期水滴伪康纤虫全长cDNA文库，初始文库滴度3.3×106pfu·mL-1，文库容量约为1.5×107 pfu，重组率97%。随机挑取24个克隆，经PCR检测插入的片段长度在0.3~2.0 kb，平均长度>500 bp。挑选文库中的1 200个克隆进行表达序列标签测序，得到1 032条高质量的EST，与NCBI数据库进行比对后，获得292个同源基因，其中包含190条单拷贝EST和102个重叠群，冗余度为71.7%。有215条EST在Tetrahymena thermophila，Paramecium tetraurelia，Ichthyophthirius multifiliis，Cryptocaryon irritans，Oxytricha trifallax等自由生活及寄生种类的纤毛虫的基因组中比对到同源基因，其中有134条EST具有功能注释，其余为未知功能的假定蛋白基因。水滴伪康纤虫cDNA文库的构建及EST测序的完成，为进一步发现和研究水滴伪康纤虫的功能基因奠定了基础