中华绒螯蟹生态育苗池塘细菌群落分析

为探究江苏省射阳地区沿海滩涂中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis）生态育苗池塘细菌群落结构，分别对养殖池塘水体（S7，S8，S9）和池塘底泥（N7，N8，N9）细菌群落16S rDNA的V3、V4、V5可变区进行扩增，检测合格的文库进行高通量测序；利用Qiime（v1.7）软件，对序列阈值97%相似性水平进行聚类分析；分别以门、纲、目、科和属的分类水平对样本进行α-多样性指数分析；以Chao指数和Shannon指数评估菌种丰富度和多样性。结果表明，3个生态育苗池塘得到OTU分别为8 881、7 406、8 566个。S7微生物归属于16门、29纲、58目、97科、191属；S8为9门、18纲、38目、68科、132属；S9为17门、32纲、60目、111科、227属。N7为41门、103纲、198目、325科、572属；N8为42门、103纲、203目、318科、534属；N9为40门、99纲、196目、323科、578属。养殖水体优势菌群以变形菌门（Proteobacteria）为主，其次是拟杆菌门（Bacteroidetes）；池塘底泥优势菌群以变形菌门（Proteobacteria）为主，其次为拟杆菌门（Bacteroidetes）、绿弯菌门（Chloroflexi）和浮霉菌门（Planctomycetes）。养殖池塘底泥中细菌群落的丰富度和物种多样性明显高于养殖水体，水体中细菌群落的丰富度S9> S7> S8，物种的多样性S7> S9> S8。池塘底泥中细菌群落的丰富度N7> N9> N8，物种的多样性N7> N9>N8