中华鲟MHC IIB基因遗传多样性初步研究

利用特异性引物MHC IIf和MHC IIr，分别从30尾野生中华鲟（Acipenser sinensis）个体、29尾子中华鲟子一代个体和30尾中华鲟子二代个体的基因组DNA中扩增MHC IIB基因的多肽结合位点（PBR）片段，扩增产物长度为168bp。中华鲟野生群体30个样品95个有效克隆中共检测出30条特异序列（单倍型），中华鲟子一代群体29个样品的96个有效克隆中共检测出38条特异序列（单倍型），中华鲟子二代群体30个样品的95个克隆中检测出36条特异序列（单倍型）。单倍型的分布及群体内遗传多样性参数分析表明，中华鲟子一代群体的MHC IIB基因遗传多样性最高，子二代中华鲟群体的MHC IIB基因遗传多样性最低。中华鲟3个群体的非同义替代(dN)与同义替代(dS)比率为1.39、1.48和1.45，非同义替换率均大于同义替换率分析表明正向选择可能是中华鲟MHC IIB多态性的主要因素。该研究结果提供了中华鲟MHC IIB基因的部分遗传信息和遗传变异规律，为中华鲟全人工种群优化和繁殖管理提供理论依据