一个园艺植物基因组序列和注释的在线批量实时提取平台

？目前,大量园艺植物基因组测序已经完成或接近尾声,它们的基因组序列和注释数据极大地促进了功能基因组学研究。为给科研人员提供批量下载特定的基因组区段序列和注释平台,笔者开发了一个称为OBRRP的生物信息学工具。OBRRP具有提取葡萄(Vitisvinifera)、桃(Prunuspersica)、草莓(Fragariavesca)、黄瓜(Cucumissativus)、西瓜(Citrulluslanatus)、番茄(Solanumlycopersicum)、甜橙(Citrussinensis)、苹果(Malusxdomestica)、猕猴桃(Actinidiachinensis)、马铃薯(Solanumtuberosum)、香蕉(Musaacuminata)和拟南芥(Arabidopsisthaliana)12种植物基因组序列及注释数据的功能;同时,也具有扩展到其它Gbrowser浏览器架构的数据库功能。测试结果表明,OBRRP是一个快捷简便的在线、批量和实时提取工具,其登录地址为http://bioinfo.jit.edu.cn/OBRRP/。