基于rna-seq识别山羊肉品质候选基因

？通过研究不同年龄和不同性别绒山羊背最长肌之间的差异表达基因，筛选影响绒山羊肉品质的候选基因。本研究基于rna-seq技术对4个绒山羊背最长肌的转录组进行高通量测序，在测序评估的基础上，对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。本研究通过clcgenomicsworkbench6.0软件共找到263个候选基因，其中包含123个高表达有利基因和140个高表达有害基因。go功能注释结果显示，高表达有利基因主要与骨骼肌的生长发育、细胞器的形成和蛋白结合功能有关；高表达有害基因主要与脂质代谢、细胞骨架以及结合功能有关。利用kegg数据库作为参考，这些基因主要参与糖酵解/糖异生、丝裂原活化蛋白激酶、凝血-补体级联反应和色氨酸代谢等通路中。结合其他家畜基因组学研究，adipoq、pdk4和cd36可能作为参与肉品质重要的候选基因。该结果为绒山羊肉品质的改善以及候选基因的研究提供了理论依据。