高通量基因芯片在压载水中检测致病菌的应用

在口岸压载水检测中发现有多种食源性致病菌的存在，给公共卫生和口岸生态环境带来极大风险。目前对食源性致病菌的检测主要是通过细菌的培养及生化鉴定、荧光PCR等方法，但是不能同时检测多种致病菌。本研究针对一种能检测12种食源致病菌的芯片进行了应用研究，用参比菌株和实验室自分离的菌株检测该芯片的特异性，结果表明该芯片的特异性良好，在所检测的菌株之间无交叉反应。在DNA水平上可以检测到110~7 000 copy的DNA分子，在菌裂解液的水平上可以检测到104~105 copy数目的菌体，样品添加实验证明1 cfu/mL的菌浓度就可以通过增菌后芯片检测到。该芯片可鉴别金黄色葡萄球菌、阪崎肠杆菌、肠出血性大肠杆菌O157∶H7、霍乱弧菌、志贺氏痢疾杆菌、空肠弯曲杆菌、单增李斯特菌、副溶血性弧菌、弯曲肠杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、蜡样芽孢杆菌和产气荚膜杆菌等。研究证明该芯片的灵敏度比PCR水平略低，但是其具备高通量、快速、准确，简单易操作等优点，可以应用于口岸压载水中携带食源致病菌的快速检测