克氏光唇鱼线粒体基因组测定及光唇鱼属的系统发育分析

根据侧条光唇鱼（Acrossocheilus parallens）线粒体基因（mtDNA）序列设计引物，采用引物步移和PCR扩增产物测序，获得了克氏光唇鱼（A. kreyenbergii）的mtDNA全序列。结构分析表明，克氏光唇鱼mtDNA为首尾闭合的环状基因，全长16 596 bp，编码37个基因，包括13个蛋白编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因和两段非编码区（D-loop和轻链复制起点OL），碱基组成具有明显的A + T偏好和反G偏倚现象。13个蛋白编码基因中，除COⅠ的起始密码子是GTG，其余基因的起始密码子均为ATG；终止密码子包括完全的终止密码子TAA（38.46%）和TAG（7.69%），不完全的终止密码子TA（15.38%）和T（38.46%）。在D-loop区的811 ~ 837 bp区间发现了一段“TA”短串联重复序列。从蛋白编码基因所包含的信息量、变异位点和变异率看，ND5、ND4、COⅠ和ND2最适合作为光唇鱼属种间系统发育分析的分子标记。采用贝叶斯法利用13个蛋白编码基因所构建的系统发育树显示，光唇鱼属和白甲鱼属（Onychostoma）的24种鱼类各自没有聚为单系群，相互间不能明确区分