红松查尔酮合成酶基因CHS密码子偏好性分析

摘要： 查尔酮合成酶（Chalcone synthase，CHS）广泛存在于植物体内，是花色素形成过程中一种重要的酶，可以进一步催化生成黄酮类化合物。本研究采用CodonW和EMBOSS在线软件对红松查尔酮合成酶基因CHS的密码子使用偏好性进行分析，并与北美乔松等其他24种植物的CHS基因以及模式植物基因组进行比较，对认识红松CHS基因的密码子使用偏好性，为选择适宜的表达系统奠定了一定的基础。研究结果表明：红松CHS基因编码区的有效密码子数（ENC）和GC含量分别为48.92和0.548，C+G含量高于A+T含量，密码子偏好以A/T结尾；多数植物CHS基因的G+C含量高于A+T含量，且密码子更偏好C/G结尾；聚类分析表明，红松与马尾松和赤松的密码子使用偏好性的相似性较高；密码子使用频率研究发现，红松CHS遗传转化与异源表达较优的受体可能是大肠杆菌和拟南芥